隨著現(xiàn)代解剖學的完善和深入，藏象學說與人體的客觀形態(tài)結構形成了越來越尖銳的矛盾。為了掩蓋中醫(yī)的根本性缺陷，現(xiàn)代中醫(yī)聲稱中醫(yī)的臟腑不是解剖學的實體器官，而是功能性為主的綜合概念。這個觀點實際上否定了中醫(yī)曾經(jīng)有過粗淺的解剖觀察，不承認中醫(yī)初的解剖學實踐，是真正的數(shù)典忘祖。
中醫(yī)歷史上真正的解剖學研究始于清代醫(yī)生王清任(公元1768-1831)，王清任感嘆道：“業(yè)醫(yī)診病，當先明臟腑”、“本源一錯，萬慮皆失”、“著書不明臟腑, 豈不是癡人說夢”、“治病不明臟腑，何異盲子夜行”。王清任多次在墳場和刑場觀察尸體，獲得了一些解剖學知識，并著成《醫(yī)林改錯》一書。
雖然王清任的解剖學成就還遠不如1500年前的蓋倫，但他尖銳地指出了“古人錯論臟腑，皆由未嘗親見”，顯示出以客觀事實為依據(jù)的探索精神?！夺t(yī)林改錯》揭示了中醫(yī)在解剖學上的欠缺和錯誤，勇敢地挑戰(zhàn)了《黃帝內(nèi)經(jīng)》和《傷寒雜病論》等經(jīng)典理論。遺憾的是，王清任有理有據(jù)的客觀觀察被當時的主流中醫(yī)體系堅決地排斥了，以陳念祖和陸九芝為代表的所謂“儒醫(yī)”視人體解剖實踐為異端邪說和左道旁門，咒罵王清任“不仁”、“狂徒”、“邪人”。
王清任一個簡單的解剖觀察就足以顛覆千年以來中醫(yī)“司外揣內(nèi)”、“以表知里”得出的錯誤觀點，從而使整個中醫(yī)理論體系崩潰，這是王清任的觀點不被接受的原因。頑固的保守勢力出于自身利益無情地扼殺了王清任推動中醫(yī)向前發(fā)展的可貴探索。
由于完全背離了客觀事實，中醫(yī)理論被迫采取了封閉的形式來維護自己。時至今日，中醫(yī)仍然拒絕一切科學標準和客觀事實的檢驗，甚至不容任何質疑。因為中醫(yī)支持者們很清楚，中醫(yī)只是一個虛幻的高樓，只要證明了其中一塊磚不存在，就等于所有的磚都不存在，整個高樓也就不存在了。假如承認了中醫(yī)對腎的描述和理解是錯誤的，那么五臟六腑又有哪個不是錯誤的?陰陽五行、藏象經(jīng)絡、病因病機、辨證施治、理法方藥等一系列理論瞬間就灰飛煙滅了。
令人驚異的是，沒有解剖學基礎的中醫(yī)居然能臆想出一整套牽強附會的理論來維護自己的虛無;更加奇特的是，這樣的“醫(yī)學”至今還受到憲法、法規(guī)和行政的庇護，與現(xiàn)代醫(yī)學并列于中國的醫(yī)療體系中。
